Maturation d’affinité

Immune Biosolutions, en collaboration avec 9Bio Therapeutics, offre plusieurs possibilités pour l’optimisation de vos anticorps.

L’évolution de la maturation d’affinité in vivo

La maturation d’affinité est un processus naturel qui a évolué afin de générer des anticorps à haute affinité en réponse aux agents pathogènes. Ce mécanisme permet une réponse immunitaire efficace et favorise la survie de l’organisme. Chez le poulet en particulier, la diversité des paratopes provient exclusivement des hypermutations somatiques.

Exploiter la maturation d’affinité naturelle par immunisation

L’immunisation est utilisée pour générer des anticorps de haute affinité en exploitant le processus naturel de maturation d’affinité.

Solutions de maturation d’affinité

L’affinité des anticorps peut être optimisée en ciblant des positions permissives au sein des régions déterminant la complémentarité (CDR), permettant ainsi la diversification des séquences tout en préservant la reconnaissance de l’antigène. Nous proposons des services de maturation d’affinité reposant sur trois niveaux de soutien computationnel, allant de l’utilisation de matrices de substitution à l’ingénierie guidée par la structure et à l’optimisation par dynamique moléculaire. Cette approche permet d’adapter chaque campagne selon l’équilibre recherché entre rapidité, profondeur d’analyse et puissance prédictive.

Aperçu des solutions disponibles

CDRH3

Le pipeline CDRH3 vise à optimiser directement la région la plus critique pour la détermination de l’affinité et de la spécificité. En réalisant une matrice de substitutions de l’ensemble des positions, ce pipeline maximise la probabilité d’identifier des mutations à fort impact dans le principal déterminant de liaison, permettant ainsi d’obtenir des gains substantiels d’affinité en une seule campagne d’ingénierie.

Affinité et affinité haute résolution

Ce pipeline de maturation d’affinité guidé par la structure exploite la modélisation moléculaire statique afin d’identifier des positions permissives dans l’ensemble des CDR. Les mutations sélectionnées sont ensuite combinées et réparties sur l’ensemble des domaines VH et VL, et les anticorps modifiés sont alors criblés par présentation sur phage ou sur levure. Ceci permet ultimement l’identification rapide de variants d’anticorps optimisés présentant une affinité et une spécificité améliorées.

La première étape du pipeline de maturation d’affinité consiste à identifier des positions permissives par modélisation computationnelle, puis à introduire une diversification ciblée par amorces dégénérées à ces positions afin de générer une diversité de variants des domaines VH et VL.

Affinité vs affinité haute résolution

Le pipeline de maturation d’affinité utilise une modélisation statique pour prédire une structure unique de l’anticorps, tandis que le pipeline haute résolution intègre des simulations de dynamique moléculaire (MD) afin d’évaluer la stabilité structurale ainsi que les déterminants énergétiques de la liaison à l’antigène.

Modélisation statique

Modélisation dynamique

Sélection finale

Une fois la bibliothèque de variants synthétisée, nous avons recours à présentation sur phage ou sur levure pour sélectionner les variants présentant les meilleures propriétés de liaison par rapport à l’anticorps parental. Cette approche permet le criblage à haut débit d’un grand nombre de variants de séquence, ainsi que l’exploration de différentes combinaisons de chaînes lourdes et légères.

Présentation sur phage

Présentation sur levure

L’équipe d’Immune Biosolutions est à votre disposition pour optimiser vos anticorps et faire progresser vos projets thérapeutiques. Contactez-nous dès aujourd’hui pour en savoir plus sur nos services de maturation d’affinité et vos projets personnalisés!